Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP2P42575 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP2P42575 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP2P42575 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms