Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL1P40616 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL1P40616 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARL1P40616 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL1P40616 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL1P40616 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARL1P40616 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms