Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GGCXP38435 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GGCXP38435 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GGCXP38435 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GGCXP38435 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms