Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms