Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms