Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM23P36406 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms