Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP214P35658 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP214P35658 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP214P35658 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP214P35658 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP214P35658 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP214P35658 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP214P35658 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms