Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5DP30049 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms