Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA3P29320 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPHA3P29320 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EPHA3P29320 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPHA3P29320 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPHA3P29320 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPHA3P29320 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPHA3P29320 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA3P29320 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms