Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GCSHP23434 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GCSHP23434 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCSHP23434 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCSHP23434 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCSHP23434 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCSHP23434 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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