Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms