Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms