Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms