Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF1RP07333 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms