Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOA1P02647 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOA1P02647 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms