Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D2O95562 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms