Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3JO75822 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms