Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIN3BO75182 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIN3BO75182 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms