Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA2O43921 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms