Protein–RNA interactions for Protein: O00213

APBB1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB1O00213 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBB1O00213 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBB1O00213 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBB1O00213 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBB1O00213 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBB1O00213 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBB1O00213 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBB1O00213 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms