Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1D1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1D1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1D1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C1D1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C1D1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C1D1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C1D1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1D1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1D1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms