Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E9PBE3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E9PBE3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms