Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM5B3KS81 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms