Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms