Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCP1A6NGW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCP1A6NGW2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms