Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms