Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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