Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRG3Q9Y2Y8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms