Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM35Q9UPQ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms