Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FBXL4Q9UKA2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms