Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXD3Q9UJU5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms