Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms