Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms