Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms