Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD3Q9NX63 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms