Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms