Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms