Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms