Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUOX1Q9NRD9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUOX1Q9NRD9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms