Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms