Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BATF3Q9NR55 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BATF3Q9NR55 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms