Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASS4Q9NQ75 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASS4Q9NQ75 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms