Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms