Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFGAP3Q9NP61 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms