Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARLQ9H300 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARLQ9H300 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARLQ9H300 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PARLQ9H300 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PARLQ9H300 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms