Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms