Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CARD11Q9BXL7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARD11Q9BXL7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARD11Q9BXL7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARD11Q9BXL7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARD11Q9BXL7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARD11Q9BXL7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARD11Q9BXL7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARD11Q9BXL7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARD11Q9BXL7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms