Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPAP1Q9BWH6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms