Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DPCDQ9BVM2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DPCDQ9BVM2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms