Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms